Klasifikace viru

Viry mohou být klasifikované v několika cestách, takový jak jejich geometrií, zda oni mají obálky, totožností organismu hostitele oni mohou infikovat, způsobem přenášení, nebo druhem nemoci, kterou oni způsobí. Nejpragmatičtější klasifikace je pravděpodobně druhem kyseliny nucleic vir obsahuje a jeho způsob vyjadřování. Toto schéma klasifikace bylo původně navrhováno Davidem Baltimoreem, kdo byl jeden z příjemců 1975 Nobelovy ceny ve fyziologii nebo medicíně. To by mělo být si všiml toho žádný z těchto klasifikace jsou čekal, že je phylogenetic jak viry nemohou sdílet obyčejný původ.

Přehled

Různé formy virů vyvstávají protože jeden z dvou prvků DNA ve kterém všechny buněčné formy života uloží jejich genetickou informaci je nadměrný, tak že viry mohou mít jeden jeden-pletl nebo dvojitý-pletl genomy. Většinou některé viry ukládají svůj genom do RNA než do DNA. RNA vyvstává v buňkách jak přechodný když geny jsou přeložené do bílkovin. RNA genomy virů mohou být zakódovány ve dvou odlišných směrech: Jeden geny jsou uloženy v 5 '? 3 ' směr (pozitivní nebo + polarita), analogický se směrem ve kterém geny jsou reprezentovány v mRNA v buňkách nebo geny jsou uloženy v opaku, 3 '? 5 ' směr (negativní nebo - polarita).

Taxonomie virů je podobná buněčným organismům.

Řád (- virales)

Rodina (- viridae)

Subfamily (- virinae)

Rod (biologie) (- vir)

Druh (biologie)

Nicméně, Kód názvosloví regulovaného mezinárodním výborem na taxonomii virů (ICTV) se liší od jiných kódů taxonomic je na několika bodech. Menší bod je že jména objednávek a rodiny jsou italicized, jak v ICBN. Nejvíce pozoruhodně, jména druhů obecně nabudou tvar [Nemoc] vir. Uznání objednávek je velmi nedávné a byl uváženě pomalý; doposud, jediný tři byli jmenováni, a většina rodin zůstane unplaced. Je známo asi 80 rodin a 4000 druhů virů.

Klasifikace podle druhu genomu

DNA viry

Skupina já - dsDNA viry (dvojitý pletl DNA)

• Řád Caudovirales (sledoval bacteriophages).
  • Rodina Myoviridae - např. Enterobacteria phage T4
  • Rodina Podoviridae
  • Rodina Siphoviridae - např. Enterobacteria phage?
• Unassigned
  • Rodina Ascoviridae
  • Rodina Adenoviridae
  • Rodina Asfiviridae
  • Rodina Baculoviridae
  • Rodina Coccolithoviridae
  • Rodina Corticoviridae
  • Rodina Fuselloviridae
  • Rodina Guttaviridae
  • Rodina Herpesviridae - např. herpesviruses člověka
  • Rodina Iridoviridae - např. Afričan vir prasečího mora
  • Rodina Lipothrixviridae
  • Rodina Nimaviridae
  • Rodina Papillomaviridae
  • Rodina Phycodnaviridae
  • Rodina Plasmaviridae
  • Rodina Polyomaviridae - např. Opičí vir 40
  • Rodina Poxviridae - např. Cowpox vir, Variola vir (neštovice)
  • Rodina Rudiviridae
  • Rodina Tectiviridae
  • Unassigned rody
    • Mimivirus; představitel druhů: Acanthamoeba polyphaga mimivirus

šroubovice

• Unassigned bacteriophages
  • Rodina Inoviridae
  • Rodina Microviridae
• Unassigned viry
  • Rodina Geminiviridae
  • Rodina Circoviridae
  • Rodina Nanoviridae
  • Rodina Parvoviridae - např. Parvovirus B19 (nejvíce záviset na coinfection s adenoviruses pro růst)
  • Unassigned rody
    • Anellovirus; představitel druhů: Točivý moment teno vir

RNA viry

Seskupit III - dsRNA viry (dvojitý pletl RNA)

• Rodina Birnaviridae
• Rodina Chrysoviridae
• Rodina Cystoviridae
• Rodina Hypoviridae
• Rodina Partitiviridae
• Rodina Reoviridae - e.g Rotavirus
• Rodina Totiviridae
• Unassigned rody
  • Endornavirus; představitel druhů: Vicia faba endornavirus

Seskupit IV - (+) ssRNA viry (pozitivní jeden pletl RNA nebo mRNA jako)

• Řád Nidovirales (“Vložený” viry)
  • Rodina Arteriviridae
  • Rodina Coronaviridae - např. Coronavirus, SARS
  • Rodina Roniviridae
• Unassigned
  • Rodina Astroviridae
  • Rodina Barnaviridae
  • Rodina Bromoviridae
  • Rodina Caliciviridae - např. Norwalk vir
  • Rodina Closteroviridae
  • Rodina Comoviridae
  • Rodina Dicistroviridae
  • Rodina Flaviviridae - např. Virus žluté zimnice, Západní Nil vir, Hepatitida C vir
  • Rodina Flexiviridae
  • Rodina Hepeviridae - např. Hepatitida E vir
  • Rodina Leviviridae
  • Rodina Luteoviridae
  • Rodina Marnaviridae
  • Rodina Narnaviridae - nahé RNA viry
  • Rodina Nodaviridae
  • Rodina Picornaviridae - např. Poliovirus, Rhinovirus, Hepatitida vir
  • Rodina Potyviridae
  • Rodina Sequiviridae
  • Rodina Tetraviridae
  • Rodina Togaviridae - např. Rubella vir
  • Rodina Tombusviridae
  • Rodina Tymoviridae
  • Unassigned rody
    • Rod (biologie) Benyvirus; představitel druhů: Řepa necrotic žlutý žilní vir
    • Rod (biologie) Cheravirus; představitel druhů: Cherry rašpluje vir listu
    • Rod (biologie) Furovirus; představitel druhů: Půda-nesená pšenice vir mozaiky
    • Rod (biologie) Hordeivirus; představitel druhů: Barley pruh vir mozaiky
    • Rod (biologie) Idaeovirus; představitel druhů: Malina huňatý maličký vir
    • Rod (biologie) Machlomovirus; představitel druhů: Maize chlorotic vir skrvnky
    • Rod (biologie) Ourmiavirus; představitel druhů: Ourmia melounový vir
    • Rod (biologie) Pecluvirus; představitel druhů: Arašídový shlukový vir
    • Rod (biologie) Pomovirus; představitel druhů: Hadr brambora-vir vrcholu
    • Rod (biologie) Sadwavirus; představitel druhů; Satsuma trpasličí vir
    • Rod (biologie) Sobemovirus; představitel druhů: Jižní fazole vir mozaiky
    • Rod (biologie) Tobamovirus; představitel druhů: Tabákový mozaikový vir
    • Rod (biologie) Tobravirus; představitel druhů: Tabákový chrastítkový vir
    • Rod (biologie) Umbravirus; představitel druhů: Mrkev vir skrvnky

Skupina V - (-) ssRNA viry (negativní jeden-pletl RNA)

• Řád Mononegavirales (non-rozdělený zápor pletl viry)
  • Rodina Bornaviridae - Borna chorobný vir
  • Rodina Filoviridae - Ebola viry, Marburg vir
  • Rodina Paramyxoviridae - např. Spalničkový virus, Virus příušnic
  • Rodina Rhabdoviridae - např. Virus vztekliny
• Rozdělený zápor pletl viry
  • Rodina Arenaviridae
  • Rodina Bunyaviridae - např. Hantavirus
  • Rodina Orthomyxoviridae - Chřipkové viry
  • Unassigned rody:
    • Rod (biologie) Deltavirus; představitel druhů: Hepatitida vir delty
    • Rod (biologie) Ophiovirus; představitel druhů: Citrus psorosis vir
    • Rod (biologie) Tenuivirus; představitel druhů: Rice pruhový vir
    • Rod (biologie) Varicosavirus; představitel druhů: Salát velký-žíla sdružila vir

DNA a RNA obrátí viry přepisování

Seskupit Vi - ssRNA-RT viry (jeden pletl RNA)

• Rodina Metaviridae
• Rodina Pseudoviridae
• Rodina Retroviridae - Retroviruses, např. HIV 1

Seskupit VII - dsDNA-RT viry (dvojitý pletl DNA)

• Rodina Hepadnaviridae - např. Hepatitida B vir
• Rodina Caulimoviridae - např. Květákový mozaikový vir

Subviral agenti

Následující agenti jsou menší než viry ale mají někteří jejich vlastností.

Viroids

• Rodina Pospiviroidae
  • Rod (biologie) Pospiviroid; představitel druhů: Bramborový hřídelový nádor viroid
  • Rod (biologie) Hostuviroid; představitel druhů: Poskokové senzační viroid
  • Rod (biologie) Cocadviroid; představitel druhů: Cadang kokosového ořechu-cadang viroid
  • Rod (biologie) Apscaviroid; představitel druhů: Apple zjizví kůži viroid
  • Rod (biologie) Coleviroid; představitel druhů: Coleus blumei viroid 1
• Rodina Avsunviroidae
  • Rod (biologie) Avsunviroid; představitel druhů: Avocado sunblotch viroid
  • Rod (biologie) Pelamoviroid; představitel druhů: Peach latentní mozaika viroid

Satelity

• Satelitové viry
  • Jeden-pletl RNA satelitové viry
    • Podskupina 1: Chronická včela-paralýzový satelitový vir
    • Podskupina 2: Odumření tabáku satelitový vir
• Satelit nucleic kyseliny
  • Jeden-pletl satelit DNAs
  • Dvojitý-pletl satelit RNAs
  • Jeden-pletl satelit RNAs
    • Podskupina 1: Velký satelit RNAs
    • Podskupina 2: Malý lineární satelit RNAs
    • Podskupina 3: Kruhový satelit RNAs

Prions

• houbové priony
• savčí priony

Jiné zdroje

Externí odkazy

• ICTV index virů
• Informovaný 8. ICTV indexová klasifikace

Viz též

• Taxonomie
• Virologie
• Vědecká klasifikace
• Binominální nomenklatura
• Trinomial názvosloví
• Seznam virů
• Wikipedia: WikiProject viry